W sobotę 5 kwietnia o godz. 10 rozpoczęła się procesja pokutna – ze śpiewem pieśni i rozważaniami, z historycznym krucyfiksem, który towarzyszył pierwszej procesji Bożego Ciała po II wojnie światowej w Gdańsku. Procesja zatrzymała się przy czterech stacjach, gdzie kapłani odczytywali rozważania poświęcone grzechowi, zaniedbaniom, przemilczeniom i utracie jedności. Po powrocie do świątyni rozpoczęła się adoracja Najświętszego Sakramentu a po błogosławieństwie i rozesłaniu spowiedników w krużgankach i kaplicy była możliwość do przystąpienia do sakramentu pokuty. Następnie rozpoczęła się Eucharystia, będąca też częścią obchodów Roku Jubileuszowego 2025 której przewodniczył abp Tadeusz Wojda.
